Veel voorkomende rubbersubstraten voor speciaal gevormde rubberen muismatten zijn onder meer vier soorten: natuurlijk rubber, nitrilrubber (NBR), met siliconenweefsel gecombineerd rubber en ethyleenpropyleendieenmonomeer (EPDM) rubber. Hiervan wordt natuurlijk rubber, met zijn goede tastgevoel en elasticiteit, vaak verwerkt tot middelgrote tot hoogwaardige kantoormuismatten of esports-muismatten; nitrilrubber, dat oliebestendig en slijtvast is, is geschikt voor scenario's die een hoge duurzaamheid vereisen. Met siliconenweefsel gecombineerd rubber (meestal gecombineerd met weefselvezels) wordt, dankzij het zachte en huidvriendelijke weefseloppervlak, vaak verwerkt in muismatten voor dagelijks gebruik die gericht zijn op comfort; EPDM-rubber, dat bestand is tegen veroudering, hoge temperaturen en vries-dooicycli, wordt soms gebruikt om speciale muismatten te maken die moeten worden blootgesteld aan variabele omgevingen.
